Mikrośrodowisko w różnicowaniu i dojrzewaniu ludzkich endokrynnych komórek trzustki - kierownik projektu prof. UAM dr hab. Małgorzata Borowiak

Konkurs do projektu w ramach dodatkowej puli miejsc do Szkoły Doktorskiej Nauk Przyrodniczych UAM w dyscyplinie: nauki biologiczne

Opis projektu

 Generowanie komórek β trzustki in vitro z ludzkich pluripotencjalnych komórek macierzystych (hPSC) ma ogromny potencjał w leczeniu cukrzycy. Pomimo znacznych postępów w różnicowaniu trzustki w ostatnich latach, kluczowym wyzwaniem pozostaje efektywne przekształcenie ludzkich progenitorów trzustkowych w pełni funkcjonalne komórki β. Ograniczenie to wynika z niepełnego zrozumienia czynników kluczowych dla różnicowania i dojrzewania komórek β.

Przeanalizowaliśmy pierwotne ludzkie komórki mezenchymalne i śródbłonkowe pochodzące z tkanki trzustkowej na etapie rozwojowym między 9. a 20. tygodniem i zaobserwowaliśmy dynamiczne zmiany w ich składzie w czasie. Dodatkowo wykazaliśmy, że współhodowla progenitorów trzustkowych pochodzących z hPSC ze specyficznymi dla danego etapu komórkami mezenchymalnymi i śródbłonkowymi zwiększa liczbę oraz funkcjonalną kompetencję komórek INS⁺.

Za pomocą sekwencjonowania RNA oraz analiz interaktomu zidentyfikowaliśmy unikalne czynniki wydzielnicze, które wspierają rozwój progenitorów endokrynnych in vitro. Wśród nich WNT5A okazał się szczególnie skuteczny w poprawie różnicowania komórek β. Odkryliśmy również nowy czynnik zaangażowany w indukcję komórek SST⁺ z ludzkich progenitorów trzustkowych.

Bazując na tych wynikach, planujemy dalsze funkcjonalne analizy komórek INS⁺ uzyskanych in vitro. W szczególności zamierzamy wyjaśnić molekularne mechanizmy regulujące ekspresję INS zależną od WNT5A, wykorzystując edycję genów, sekwencjonowanie RNA pojedynczych komórek, cytometrię przepływową pojedynczych komórek oraz różne techniki biologii molekularnej i komórkowej. Ponadto zbadamy wzajemne oddziaływania pomiędzy WNT5A, BMP oraz innymi szlakami sygnałowymi w procesie specyfikacji komórek β, a także mechanizmy różnicowania komórek δ in vitro.

Podsumowując, nasze badania pokażą, w jaki sposób czynniki pochodzące z mikrośrodowiska trzustki mogą odtworzyć warunki in vivo w systemie in vitro, co ułatwi generowanie w pełni funkcjonalnych komórek β do zastosowań translacyjnych. Nowo zidentyfikowane sygnały mogą umożliwić efektywną produkcję ludzkich komórek β i innych endokrynnych komórek trzustkowych, prowadząc do stworzenia ludzkich wysp trzustkowych zawierających różne typy komórek endokrynnych na potrzeby medycyny regeneracyjnej.

Wymagane kwalifikacje:

• ·     ukończone studia II stopnia, kierunek: biologia molekularna, biologia komórki, biologia rozwojowa lub biochemia
• ·   doświadczenie w pracy laboratoryjnej w tym podstawowe umiejętności z zakresu technik biologii molekularnych i kultur komórkowych mile widziane
• ·   wiedza z obszaru biotechnologii i biologii rozwoju
• ·   ciekawość naukowa, wysoka motywacja i entuzjazm, niezależność i rzetelność
•      umiejętność pracy w zespole 
• ·   znajomość języka angielskiego w mowie i piśmie pozwalającym na czytanie oraz pisanie prac naukowych, a także swobodną komunikację  werbalną 

Kierownik projektu: prof. UAM dr hab. Małgorzata Borowiak UMO- 2020/37/B/NZ3/01917

Rekrutacja

Komisja Rekrutacyjna

• dr hab. prof. UAM Małgorzata Borowiak – przewodnicząca komisji
  dr hab. prof. UAM Maciej Łałowski – członek komisji
  dr hab. prof. UAM Anita Szwed – członek komisji
  dr hab.prof. UAM  Magdalena Arasimowicz-Jelonek - członek komisji
  dr Katarzyna Błaszczyk – członek komisji
  dr Wojciech Szlachcic – sekretarz komisji

Harmonogram rekrutacji:

Opłata rekrutacyjna

Opłata rekrutacyjna do szkoły doktorskiej wynosi 300 zł.

Forma postępowania kwalifikacyjnego

Język postępowania kwalifikacyjnego, w tym rozmowy kwalifikacyjnej

Język polski lub języku angielskim. 

Wymagane dokumenty  

Osoba ubiegająca się o przyjęcie do Szkoły Doktorskiej rejestruje sie w systemie IRK (Interentowa Rejestracja Kandydata) i składa dokumenty w formie elektronicznej.

Kandydat zobowiązany jest do:  

1)     wypełnienia formularza rejestracyjnego i załączenia zdjęcia w wersji elektronicznej o wymiarach 20 mm x 25 mm w rozdzielczości co najmniej 300 dpi;

2)     określenia dyscypliny naukowej, w której kandydat będzie odbywał kształcenie w szkole doktorskiej;

3)     wyrażenia zgody na przetwarzanie danych osobowych na potrzeby rekrutacji;

4)     wprowadzenia wyników z egzaminów dyplomowych;

5)     załączenia CV;

6)     załączenia skanu listu motywacyjnego podpisanego odręcznie wraz ze wskazaniem dyscypliny naukowej, w której kandydat chciałby uzyskać stopień naukowy doktora;

7)     załączenia skanu odpisu dyplomu ukończenia studiów wyższych, potwierdzającego uzyskanie kwalifikacji na poziomie 7. Polskiej Ramy Kwalifikacji, a w przypadku absolwentów z roku akademickiego 2023/2024, którym nie został wydany jeszcze dyplom, zaświadczenia o uzyskaniu kwalifikacji na poziomie 7. Polskiej Ramy Kwalifikacji. W przypadku kandydatów, którzy ubiegają się o przyjęcie do szkoły doktorskiej na podstawie najwyższej jakości osiągnięć naukowych wymagany jest odpowiednio: dla absolwentów studiów pierwszego stopnia dyplom ukończenia tych studiów wraz z suplementem a dla studentów po ukończonym 3 roku jednolitych studiów magisterskich zaświadczenie o uzyskanej średniej studiów z lat 1-3 wraz z kartą przebiegu studiów;

8)     załączenia skanu podpisanego odręcznie oświadczenia o niepodjęciu kształcenia w innej szkole doktorskiej oraz o nieposiadaniu stopnia doktora;

9)     załączenia skanu podpisanego odręcznie oświadczenia o udokumentowanych osiągnięciach oraz dokumentów potwierdzających te osiągnięcia  (tłumaczenie na język polski lub angielski)  należy wskazać osiągnięcia podlegające ocenie:

a)  w liczbie do 3 – w przypadku osiągnięć naukowych;

b)  w liczbie do 3 – w przypadku innych osiągnięć

- zgodnych z kryteriami, o których mowa w § 10.

10) załączenia skanu podpisanej odręcznie propozycji autorskiego projektu badawczego a w przypadku rekrutacji w związku z realizacją projektu badawczego – autorskiej koncepcji realizacji projektu grantowego, wraz z bibliografią (do 8 stron standardowego maszynopisu, maks. 15 000 znaków ze spacjami);

11) załączenia skanu pobranego z systemu IRK podpisanego odręcznie podania o przyjęcie do szkoły doktorskiej;

       12) wniesienia opłaty rekrutacyjnej,

 

  Osoby, które uzyskały niezbędne wykształcenie poza terenem Rzeczypospolitej Polskiej, składają dodatkowo: 

• potwierdzoną za zgodność z oryginałem kserokopię dokumentu poświadczającego wykształcenie – dyplom z suplementem studiów pierwszego stopnia (Bachelor degree) i dyplom z suplementem studiów drugiego stopnia (MSc, MA) w języku oryginalnym i w poświadczonym tłumaczeniu na język angielski lub na język polski;
• kserokopię paszportu.

Kryteria oceny

W postępowaniu rekrutacyjnym uwzględnia się:

 1)     ocenę z dyplomu studiów drugiego stopnia, jednolitych magisterskich, nie więcej niż 10 pkt; w przypadku kandydatów, którzy ubiegają się o przyjęcie na podstawie najwyższej jakości osiągnięć naukowych („Perły Nauki”), 10 pkt;

 2)     ocenę dotychczasowej aktywności naukowej oraz osiągnięć naukowych kandydata; kandydat wskazuje do oceny maksymalnie trzy udokumentowane osiągnięcia naukowe, zgodne z kryteriami osiągnięć kandydata przyjętymi przez komisję rekrutacyjną dla danej dyscypliny; nie więcej niż 15 pkt;

 3)     inną udokumentowaną działalność kandydata, na podstawie wskazanych przez kandydata maksimum trzech osiągnięć zgodnych z kryteriami osiągnięć kandydata przyjętymi przez komisję rekrutacyjną dla danej dyscypliny, nie więcej niż 5 pkt;

 4)     wynik rozmowy kwalifikacyjnej, przy czym zakres rozmowy kwalifikacyjnej obejmuje:

 a)     wiedzę oraz kompetencje kandydata istotne dla planowanych badań oraz właściwe dla wskazanej dyscypliny naukowej,

 b)     elementy metodologii badań właściwe dla wskazanej dyscypliny.

 Za rozmowę kwalifikacyjną można otrzymać nie więcej niż 50 pkt; maksymalny czas trwania rozmowy kwalifikacyjnej może wynieść 30 minut.

 5)     ocenę przygotowanego na potrzeby rekrutacji projektu badawczego (nie więcej niż 20 pkt), ze szczególnym uwzględnieniem:

 a)     umiejętności sformułowania celu badań oraz przedstawienia problemu badawczego;

 b)     pomysłu badawczego oraz umiejętności zaproponowania sposobu rozwiązania;

 c)     metodologii właściwej dla wskazanej dyscypliny;

 d)     znajomości stanu badań wraz z podstawową bibliografią.

Warunki przyjęcia do szkoły doktorskiej

Maksymalna liczba punktów to 100 punktów. Warunkiem przyjęcia do szkoły doktorskiej jest znalezienie się na liście rankingowej, w obrębie limitu miejsc dla danej dyscypliny naukowej i uzyskania minimum 60 punktów z całości postępowania kwalifikacyjnego.

Program kształcenia

Kształcenie w szkole doktorskiej trwa 8 semestrów. Kształcenie  prowadzone jest na podstawie ramowego planu kształcenia oraz indywidualnego planu badawczego i kończy się złożeniem rozprawy doktorskiej.

Ramowy plan kształcenia  w szkole doktorskiej obejmuje katalog modułów zajęć obowiązkowych, obowiązkowych do wyboru i fakultatywnych wraz z:

1)    określeniem ich harmonogramu

2)    sposobem ich realizacji

3)    weryfikacją efektów uczenia się.  

Promotorzy

Doktorant pracuje pod kierunkiem promotora lub promotorów albo promotora i promotora pomocniczego, którzy będą wyznaczeni w terminie 3 miesięcy od rozpoczęcia kształcenia w szkole doktorskiej.

Stypendia

 Wysokość stypendium wynosi 5000 PLN brutto-brutto do oceny śródokresowej